(🏂)21世纪初(chū )，人类将(jiāng )多数人留在被哥斯(🥫)拉蹂躏的地(🚻)球上，仅使(💠)被(👺)选中的人(🎋)们乘(🕐)上(🐀)恒星间移民(⚾)船·阿拉特拉姆(❕)，前(💹)往(💔)能够移(yí )居的“约(yuē )定之(🦇)地(dì )·τ(➡)星e”。但这一计划失败，人类只得(dé )再(zài )(💯)度返回地球(qiú )。而长距(🤔)离亚空间航行所引发(fā )(💏)的时空歪(wāi )曲，导致人类回到(dào )的地方(fāng )变成了“两万年后的地(🔥)球”。在这个(🚽)地球，主人公·晴男等人在遭受哥斯(sī )拉袭击的(de )同时，与埃克西(😉)弗、(🚩)比(bǐ )尔沙尔(ěr )德两种(zhǒng )(⏺)族(zú )的异(yì )星(xīng )人共同实行谋(💕)划了20年的(💛)“对哥斯(sī )(⛅)拉战术”，通过殊(shū )死战斗成功击倒(dǎo )了哥斯拉。
　　但喜悦并未持(🎁)续(xù )多久(jiǔ )，深藏地下(xià )的真正哥斯拉“哥斯(🍑)拉·地(dì )球”现身了(le )。两万年间(jiān )持续成长生存(👆)、身高(gāo )(🏌)300米、质量超(🚇)过(😀)10万(🍄)吨，在进化成这种姿(zī )态(🐁)的(⤴)超巨大哥斯(sī )拉(lā )(🗻)压倒性的破(pò )坏力面前，晴男(nán )等人(👑)落(🔷)花流水。
　　拯救(🚑)了晴(qíng )男(nán )的是(shì )(🛴)被(bèi )视(shì )为人类的残存者“弗(fú )图亚”之(😯)民，米(mǐ )亚娜(😫)。弗图(🛹)亚(yà )是他们在这个地球首(shǒu )次(🚒)遇到的人型生命(mìng )种族。他(tā )们会(⚡)是人类的子孙(🍶)吗——。“弗图(😍)亚(♟)的(✒)神也被哥斯拉(lā )(😾)击破(pò )，如(rú )今只剩(😙)下(👫)卵(💝)。挑战者、(❎)抗(kàng )争者(zhě )，全部被火焰吞(Ⓜ)噬而(🚴)消失了”面对这(✏)样(yàng )的他们，晴男回应道“这是(shì )以人(rén )类的(㊙)双手(🖇)夺(📈)回地球的最(zuì )后机会了”。
　(🕦)　另(lìng )一方(fāng )面，比尔沙尔德的(🐹)指(zhǐ )挥官·加尔格(💨)，注(zhù )意(yì )到(dào )弗图亚使用的箭头是由“自律思考金(📖)属体·纳(nà )米金(jīn )属”所制(✒)造而欢喜(📄)。这(😯)和21世(shì )纪(jì )他们在富(fù )士山麓作(🍆)为“对哥斯拉决战兵器”所开(kāi )发、在启(qǐ )动(😜)前遭到破坏(🏩)的“机械哥斯(sī )拉(🕜)”由同种物质所(🌿)构(gòu )(🌎)成。这正是当(💑)时的(🚁)开(🔦)发设备至(🎄)今仍然残存(cún )的证明(🤕)——。