晴朗(lǎng )(🏂)时节(🤠)，江户川柯(kē )南（高山南 配音(yīn )）和毛利(lì )小(🧤)五郎（小山力也 配音(🏯)）、小兰（(🐀)山崎(qí )和佳(jiā )奈 配(🌮)音(yīn )）以(yǐ )及少(❕)年侦探团的伙(🍑)伴们一同来到京都(dōu )，他(tā )们(🐛)即将(⛏)登上(shàng )自卫队(🃏)的宙(zhòu )斯盾战舰，体验一(yī )(🔈)把(bǎ )出海(💿)作战的感觉，期间(jiān )还结识了美丽(lì )又(🥤)有(yǒu )着几(♌)分神秘的女自卫(wèi )队(duì )员藤井七海（柴咲幸 配音）。谁知快乐的氛围(🔲)很快(kuài )被(😳)恐(👗)慌所替(🚻)代，战舰(jiàn )上突(tū )然(rán )发现(💅)一(yī )条断(📬)掉的手(shǒu )臂，消失的自卫队(❄)员又引起(🧥)军(🔮)方的恐慌(🔬)与猜测。原来某国神秘(mì )间(👼)谍X已悄悄登上宙斯盾(dùn )，伺机盗(dào )(🚓)取(📯)战舰上的绝密情报。
　　为了找出隐(🎁)藏的对手，柯南和(🎅)灰原哀（林原(yuán )惠美 配音(yīn )(🛳)）、阿笠博士（(🌛)绪方贤一 配音）、服部(🈵)平(píng )次(🏌)（堀(kū )川(🍄)亮(🕝) 配音）以(😀)及远山(🍄)和(hé )叶（(❔)宫村优子 配(pèi )音(yīn )）(⤴)通力(lì )合作，与(🗻)间谍展(zhǎn )(🔝)开连(lián )番(fān )斗智(zhì )斗勇的较量…